至七月，撤回江户的德川秀忠已经是死局，既无援军，又无出路。

明军方向，受国内叛乱影响，前线受到的压力日益增加。第一军司令官曹文耀在和尚鸟元的建议下命令对江户实施火攻计划。

此举，让江户城陷入一片火海之中，保守估计约有三分之二的建筑被烧毁。

26日，响应新日本国和皇军号召的幕府有识之士在城中发起了叛乱，有识之士们打开了城门，明军汹涌杀入，德川秀忠死。

至此，德川幕府宣告灭亡，日本正式迎来“明治时代”。

远在京都的魏良臣公公闻讯后，欣喜题词——“一个崭新的时代到来了！”